- Actinomicetos – São bactérias com organização filamentosa, muitas vezes ramificada. Dada sua semelhança com fungos e por produzirem, como estes, cadeias de esporos semelhantes a conídios, os Actinomicetos são com frequência erroneamente classificados como tais. Ao contrário dos fungos, porém, são organismos procarióticos em sua grande maioria aeróbios. Os representantes do gênero Frankia vivem em simbiose com as raízes de plantas superiores (por exemplo, da Casuarina sp.), onde levam à formação de nódulos, no interior dos quais ocorre fixação de nitrogênio.
Aminoácidos – são compostos quaternários de carbono (C), hidrogénio (H), oxigénio (O) e nitrogénio (N) – às vezes contêm enxofre (S), como a cisteína. A estrutura geral dos aminoácidos envolve um grupo amina e um grupo carboxilo, ambos ligados ao carbono α (o primeiro depois do grupo carboxilo). O carbono α também é ligado a um hidrogénio e a uma cadeia lateral, que é representada pela letra R. O grupo R determina a identidade de um aminoácido específico.
Aminotransferase – Aminotransferases ou transaminases são um grupo de enzimas que catalisam a interconversão de aminoácidos e oxiácidos por transferência de grupos amino.
Amônio – O cátion amônio é um íon poliatómico carregado positivamente com fórmula química NH₄⁺. Tem massa molecular 18,04 e é formado por protonação do amoníaco. As características deste íon são semelhantes às dos íons de metais alcalinos
Anaplerótico – qualidade de uma reação de fornecer um reagente que é limitante em outra reação ou rota. A PEP carboxilase, por exemplo reabastece o oxaloacetato usado para a biossíntese do ácido cítrico.
Anóxico – refere-se a ausência de oxigênio.
Atividade catalítica – Se refere à taxa pela qual a reação alcançará o equilíbrio.
Bactérias – É um domínio de micro-organismos unicelulares, procariontes (desprovidos de envoltório nuclear e organelas membranosas), antes também chamados Schizomycetes, pertencentes ao Reino Monera.
Bactérias nitrificadoras – São as principais transformadoras da amônia em nitratos através das nitrossomonas e de amônia em nitritos através das nitrobacter.
Bacterioides – é um género de bactérias gram-negativas, anaeróbias obrigatórias. Bacteriossomo
Beta oxidação – oxidação de ácidos graxos em graxo-acil Coa e a decomposição seqüencial dos ácidos graxos em um número de pares de duas moléculas de acetil Coa.
Bombas – proteínas de membrana que realizam o transporte ativo primário através de uma membrana biológica
Cadeia de transporte de elétrons na mitocôndria – uma série de complexos protéicos na membrana mitocondrial interna, ligados pelos transportadores móveis de elétrons ubquinona e citocromo c, e que catalisam a transferência de elétrons de NADH para oxigênio. No processo, é liberada uma grande quantidade de energia. Parte da energia é conservada como um gradiente eletroquímico de prótons
Cadeia respiratória – Ou cadeia transportadora de elétrons é uma das etapas da respiração celular, que se caracteriza pelo transporte de elétrons em uma compilação de moléculas fixadas na membrana interna da mitocôndria de células eucarióticas até um aceptor final de elétrons, em várias etapas liberadoras de energia para síntese de ATP (adenosina trifosfato). Em organismos procariotos aeróbios, essas moléculas residem na membrana plasmática.
Cianobactérias – O filo Cyanobacteria (cianobactérias), ou divisão Cyanophyta (cianófitas), é um grupo de bactérias que obtêm energia por fotossíntese. São chamadas também de algas azuis ou algas verde-azuladas, embora alguns autores considerem estes nomes inadequados, uma vez que cianobactérias são procarióticas, e algas deveriam ser apenas eucarióticas. Inclui organismos aquáticos, unicelulares, coloniais ou filamentosos fotossintéticos.
Ciclo do ácido cítrico (ciclo de Krebs, ciclo dos ácidos tricarboxílicos) – um ciclo de reações localizadas na matriz mitocondrial catalisadoras da oxidação de piruvato à CO2; ATP e NADH são gerados no processo de oxidação
Ciclo do glioxilato – a seqüência de reações que converte duas moléculas de Acetil Côa em succinato no glioxissomos.
Citocromo c – um componente periférico e móvel da cadeia mitocondrial de transporte de elétrons, que oxida o complexo III e reduz o complexo IV.
Clorato – Um clorato é um sal que contém o ânion ClO3–, derivado do ácido clórico HClO3. Contém o cloro no estado de oxidação +5. Trata-se de oxidante forte já que pode ser oxidado a perclorato ClO4–. Devido ao seu elevado caráter oxidante e sua alta instabilidade associada não é encontrado na natureza.
Coenzima A – uma coenzima com o grupo-SH, que serve como carregador de grupo Acil de muitas reações enzimáticas
Co-fator – São substâncias orgânicas ou inorgânicas necessárias ao funcionamento das enzimas. Se um cofator for orgânico, recebe o nome de coenzima.
Complexo I – um complexo protéico na cadeia mitocondrial de transporte de elétrons, que oxida NADH e reduz ubiquinona.
Complexo II – um complexo protéico na cadeia mitocondrial de transporte de elétrons, que oxida succinato e reduz ubiquinona.
Complexo III – um complexo protéico na cadeia mitocondrial de transporte de elétrons, que oxida ubiquinono reduzida (ubiquinol) e reduz citocromo c.
Complexo IV – um complexo protéico na cadeia mitocondrial de transporte de elétrons, que oxida citocromo c reduzido e reduz oxigênio a água.
Complexo V – Ver F0F1 ATP sintase.
Covalente – A ligação covalente é um tipo de ligação química que ocorre com o compartilhamento de pares de elétrons entre átomos que podem ser o hidrogênio, ametais ou semimetais.
Desnitrificação – É o fenômeno de transformação de nitratos e outras substâncias em gás nitrogênio (N2) pela ação de bactérias desnitrificantes.
Enzima nitrogenase – Enzima que reduz o N2 a amónia (NH3). Esta conversão é a principal etapa na fixação de nitrogênio atmosférico, realizada por organismos diazotróficos.
F0F1 ATP sintase – um complexo multi-proteína associado à membrana mitocondrial interna, que acopla a passagem de prótons através da membrana para a síntese de ATP a partir de ADP e fosfato.
FAD (Flavina adenina dinucleotídeo) – um cofator contendo riboflavina que sofre uma redução reversível de um ou dois elétrons para produzir FADH ou FADH2.
Ferredoxina – A ferredoxina é uma proteína ferroenxofre solúvel em água presente na cadeia de transporte de elétrons do cloroplasto. A ferredoxina doa seus elétrons para o NADP+, produzindo NADPH.
Flavonoides – É a designação dada a um grande grupo de metabólitos secundários da classe dos polifenóis, componentes de baixo peso molecular encontrados em diversas espécies vegetais.
Glicólise – uma série de reações em que a glicose é parcialmente oxidada para produzir duas moléculas de piruvato. È produzida uma pequena quantidade de ATP e NADH.
Gliconeogênese – a síntese de carboidratos através da inversão da glicólise.
Glioxissomo– uma organela encontrada nos tecidos de sementes ricos em óleos, em que os ácidos graxos são oxidados. Um tipo de microcorpo.
Gradiente de prótons – Refere-se às propriedades elétricas e químicas que ocorrem através das membranas. Os gradientes são muitas vezes resultado de gradientes iónicos, nomeadamente protônicos, e podem representar um tipo de energia potencial que está disponível para executar trabalho em processos celulares.
Heterocitos das cianobactérias – O heterocisto é um tipo de célula especializada na fixação de nitrogênio atmosférico, presente nalgumas espécies de cianobactérias filamentosas. As suas paredes são espessas, dificultando a troca de gases como o dioxigénio na célula e ajudando a manter assim um ambiente intracelular essencialmente anaeróbio.
Hidrólise – É uma reação química de quebra de ligação química de uma molécula com a adição de uma molécula água. Nessa reação ocorre a quebra da molécula de água em íons de hidrogênio (H+) e hidroxila (OH–) que se ligam às duas moléculas resultantes da quebra, estas últimas podem ter caráter positivo e negativo.
Hipóxico – refere-se as baixas concentrações de oxigênio
Lixiviação – Extração ou solubilização dos constituintes químicos de uma rocha, mineral, solo, depósito sedimentar entre outros, pela ação de um fluido percolante. Quando ocorre ações físicas, a terra fica permeável de modo grosseiro, acontecendo o tal fenômeno que também é chamado de lavagem.
Lúmen – É a parte viva da célula, delimitada pela parede celular. Nas células vivas, este espaço interno é ocupado pelo protoplasma, que consiste na: membrana plasmática, citoplasma e núcleo. Nas células mortas, o lúmen não apresenta mais o protoplasma.
Metabolismo aeróbico – Refere-se a um processo bioquímico que representa a forma mais eficaz de obter energia a partir de nutrientes como a glicose, na presença obrigatória de oxigênio.
NAD (Nicotina adenina dinucleotídeo) – molécula que participa de reações de oxidação, recebendo um íon hidreto (H-) de uma molécula doadora, produzindo NADH que atua como carreador ativa de elétrons. Importante no catabolismos de açúcares e gordudas.
NADH – Dinucleótido de nicotinamida e adenina é uma coenzima que apresenta dois estados de oxidação: NAD+ (oxidado) e NADH (reduzido). A forma NADH é obtida pela redução do NAD+ com dois elétrons e aceitação de um próton (H+).
NADPH – é a forma reduzida do NADP+. Difere do NAD+ pela presença de um grupo adicional de fosfato na posição 2’da ribose do anel que transporta a porção adenina.
Nitrobacter – É um género de bactérias em forma de bastonete. Desempenham um papel importante no ciclo do nitrogênio, oxidando os nitritos do solo em nitrato.
Nitrosomonas – É uma proteobactéria nitrificante. Importantepara o ciclo do nitrogênio, no qual transforma o amônio em nitrito.
NO – O óxido nítrico, de fórmula química NO, é um gás solúvel, altamente lipofílico.
Nodulação – Produção de nodosidades nas raízes das leguminosas pela ação de bactérias simbióticas fixadoras de nitrogênio.
Organelas endossimbióticas – A Teoria da Endossimbiose, também conhecida como Endossimbiose Sequencial, proposta por Lynn Margulis, propõe que organelos ou organóides, que compõem as células eucariontes tenham surgido como consequência de uma associação simbiótica estável entre organismos. Mais especificamente, esta teoria postula que os cloroplastos e as mitocôndrias (organelas celulares) dos organismos eucariontes (com um verdadeiro núcleo celular) têm origem num procarionte heterotrófico – provavelmente um antepassado das cianobactérias atuais – que viveu em simbiose dentro de outro organismo, também unicelular, mas provavelmente de maiores dimensões, obtendo assim proteção e fornecendo ao hospedeiro a energia fornecida pela fotossíntese.
Oxidação – perda da densidade eletrônica de átomo, como ocorre pela adição de oxigênio a uma molécula ou pela remoção de hidrogênio.
pH – É símbolo para uma medida físico-química potencial hidrogeniônico ou potencial de hidrogénio, que indica a acidez, neutralidade ou alcalinidade de uma solução aquosa.
Plastídeos – Chamam-se plastídeos ou plastos a um grupo de organelas encontrados nas células das plantas e das algas, responsáveis pela fotossíntese
Procariontes – Organismos unicelulares simples que não possui compartimentalização membranosa dos seus produtos intracelulares, ou seja, não apresenta compartimentos dentro da célula (metabólitos dispersos no citoplasma), nem núcleo verdadeiro (cromossomo disperso no citoplasma).
Reações redox – As reações de redução-oxidação ou oxirredução (também conhecido como reação redox) são as reações de transferência de elétrons. Esta transferência se produz entre um conjunto de espécies químicas, um oxidante e um redutor (uma forma reduzida e uma forma oxidada respectivamente).
Redução – adição de elétrons a um átomo, como ocorre durante a adição de hidrogênio ou pela remoção de oxigênio a uma molécula
Relações simbióticas mutualísticas – Interação (relação) entre duas espécies, em que ocorrem benefícios para ambas.
Respiração – a oxidação completa de compostos de carbono a dióxido de carbono e água, usando oxigênio como aceptor final de elétrons. A energia é liberada e conservada como ATP
Rizóbios – São bactérias pertencentes a família Rhizobiaceae, capazes de produzir nódulos e fixar nitrogênio em raízes de plantas (simbiose).
Sistema simporte – É o transporte de duas substâncias num mesmo sentido no carreador.
Sistema uniporte – É o transporte de um único elemento num determinado sentido através de uma proteína carreadora ou canal, com ou sem gasto de energia.
Tilacoides – são uma espécie de lamelas presentes nos cloroplastos (e também nas cianobactérias), formadas por estruturas membranosas em forma de vesícula achatada, que, dispostas umas sobre as outras constituem os grana (tilacoides dos grana) ou, quando expostas e sem empilhamento constituem os intergrana.
Tonoplasto – É uma membrana lipoprotéica que delimita os vacúolos das células vegetais
Transporte ativo – o uso de energia para mover um soluto através de um membrana contra um gradiente de concentração, um gradiente potencial, ou ambos. Transporte contra um gradiente de concentração
Transporte passivo – difusão através da membrana. O movimento espontâneo de um soluto através de uma membrana, na direção de um gradiente de potencial eletroquímico. Transporte através de um gradiente de concentração.
Vacúolo – São estruturas celulares, muito abundantes nas células vegetais, contidas no citoplasma da célula, de forma mais ou menos esféricas ou ovalado, geradas pela própria célula ao criar uma membrana fechada que isola um certo volume celular do resto do citoplasma.